Hola.
Por ciencias sin duda. Hace tiempo que hice el bachiller y puede que haya cambiado un poco, pero por lo que sé (yo no hago medicina, pero conozco a gente) prepárate para estudiar duro. No es por desanimarte, sino para avisarte por que lo tienes que tener claro si quieres entrar en medicina, yo no sé como es en otros sitios, pero por lo menos en mi ciudad la nota de corte es espectacular. Procura sacar notazas en primero (sobresalientes), ya que el bachillerato de ciencias sube bastante el nivel en segundo y te va a costar más. En segundo procura coger matemáticas, biología, física y química. Si coges estas 4 podrás presentarte a la selectividad por dos modalidades distintas y, aunque tengas que estudiar una asignatura más para el acceso merece la pena porque tienes más posibilidades de subir nota (eliges la nota mayor). Actualmente después de 5 años preparas el mir (un examen obligatorio para ser médico) y la especialización, ya con prácticas pagadas, pero no confíes mucho en eso, que ahora con Bolonia están cambiando todos los planes de estudio. De momento centrate en entrar. Yo te aconsejo que mires las notas de corte de el sitio donde tengas pensado estudiar medicina y en primero intentes sacar dos puntos por encima en cada examen. Mucho animo.